Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr2Q62371 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr2Q62371 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr2Q62371 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr2Q62371 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddr2Q62371 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddr2Q62371 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ddr2Q62371 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr2Q62371 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr2Q62371 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr2Q62371 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms