Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim28Q62318 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim28Q62318 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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