Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prg2Q61878 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms