Protein–RNA interactions for Protein: Q61772

Epha7, Ephrin type-A receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha7Q61772 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha7Q61772 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha7Q61772 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha7Q61772 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms