Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccne1Q61457 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms