Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irf9Q61179 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms