Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf4bQ61136 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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