Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cln3Q61124 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms