Protein–RNA interactions for Protein: Q60I26

Als2cl, ALS2 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2clQ60I26 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Als2clQ60I26 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Als2clQ60I26 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms