Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms