Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf8Q60846 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms