Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf3Q60803 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms