Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms