Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P4ha2Q60716 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P4ha2Q60716 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P4ha2Q60716 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms