Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a1Q60714 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc27a1Q60714 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc27a1Q60714 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc27a1Q60714 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc27a1Q60714 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a1Q60714 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a1Q60714 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms