Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samhd1Q60710 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms