Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ItgaeQ60677 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms