Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sik1Q60670 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms