Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CttnQ60598 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CttnQ60598 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CttnQ60598 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CttnQ60598 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CttnQ60598 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291.9 ms