Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms