Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a3Q5XF89 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a3Q5XF89 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 260.6 ms