Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms