Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Trim38Q5SZ99 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Trim38Q5SZ99 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Trim38Q5SZ99 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim38Q5SZ99 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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