Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d1Q5SSN7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms