Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TefmQ5SSK3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms