Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Fam46cQ5SSF7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms