Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps54Q5SPW0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms