Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf12Q5SPL2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms