Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85aQ5SP85 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms