Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11eQ5S248 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11eQ5S248 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11eQ5S248 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11eQ5S248 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11eQ5S248 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11eQ5S248 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11eQ5S248 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11eQ5S248 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11eQ5S248 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11eQ5S248 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11eQ5S248 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss11eQ5S248 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmprss11eQ5S248 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms