Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlha9Q5RJB0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms