Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv4Q5R1A3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms