Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Scarf1Q5ND28 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf1Q5ND28 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms