Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.81■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Trim41Q5NCC3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Trim41Q5NCC3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms