Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CoblQ5NBX1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms