Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms