Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ecm2Q5FW85 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm2Q5FW85 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms