Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5EBG8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5EBG8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5EBG8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms