Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtl5Q5DTT4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rtl5Q5DTT4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rtl5Q5DTT4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rtl5Q5DTT4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Rtl5Q5DTT4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtl5Q5DTT4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms