Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme2Q56A04 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms