Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spire1Q52KF3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spire1Q52KF3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spire1Q52KF3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spire1Q52KF3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spire1Q52KF3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Spire1Q52KF3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spire1Q52KF3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spire1Q52KF3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms