Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Syne3Q4FZC9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syne3Q4FZC9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms