Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
6430531B16RikQ3V2J1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430531B16RikQ3V2J1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms