Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms