Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2Q3V1H1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms