Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms