Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp48Q3V0C5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp48Q3V0C5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms