Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4933416C03RikQ3V063 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933416C03RikQ3V063 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms