Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn13Q3UW68 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms