Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdc42bpaQ3UU96 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdc42bpaQ3UU96 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms